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metadata.dc.type: Dissertação
Title: Análise transcriptomica de prasiola crispa (lightfoot) kützing revela estratégias de resistência ao ambiente antártico
metadata.dc.creator: Macedo , Pablo Echeverria
metadata.dc.contributor.advisor1: Pinto, Paulo Marcos
metadata.dc.contributor.advisor-co1: Wallau, Gabriel da Luz
metadata.dc.contributor.referee1: Albuquerque, Margeli Pereira de
metadata.dc.contributor.referee2: Boldo, Juliano Tomazzoni
metadata.dc.description.resumo: O continente Antártico se encontra aproximadamente centralizado no polo sul da Terra, sendo completamente isolado pelo encontro dos oceanos Atlântico, Pacífico e Índico. A Antártica é o continente com as condições ambientais mais severas, onde estão presentes frio intenso, seca fisiológica, ventos severos e limitações de nutrientes. A composição da vida presente na Antártica é muito específica, com a presença de organismos incluindo procariotos e eucariotos, como fungos, protistas e algas. Entre as algas, Prasiola crispa (Lightfoot) Kützing é o organismo mais comumente encontrado, representando um importante produtor primário. Entretanto, os mecanismos moleculares envolvidos com o potencial adaptativo de P. crispa a esse ambiente são ainda desconhecidos. Sendo assim, para melhor compreender a capacidade de adaptação e desenvolvimento de P. crispa a estas condições, realizou-se através de sequenciador Illumina-Hiseq 2500, a obtenção do transcriptoma desse organismo. Posteriormente, baseando-se na utilização de softwares específicos, realizou-se a respectiva montagem e anotação dos dados advindos do sequenciamento. A montagem do transcriptoma de P. crispa resultou em 37.679 contigs, com um N50 de 1.389. O procedimento de anotação permitiu a identificação dos organismos com maior similaridade com P. crispa, onde destacou-se outra Chlorophyta pertencente ao ambiente antártico. Pode-se realizar a classificação dos transcritos em três diferentes categorias: processos biológicos, funções moleculares e componentes celulares; assim como a visualização dos seus respectivos E-values. Por fim, pode-se realizar a identificação de 27 transcritos que possivelmente auxiliam P. crispa a se tornar apta a sobreviver no ambiente antártico. Sendo os mesmos distribuídos em características relacionadas à resistência e tolerância a baixas temperaturas, alta incidência de radiação ultravioleta, transporte de substâncias e altos níveis de salinidade.
Abstract: The Antarctic continent is approximately centralized at the south of the Earth, being completely isolated in the meeting of the Atlantic, Pacific and Indic oceans. The Antarctic is a continent with the most severe conditions, where are present intense cold, physiological drought, severe winds and nutrient limitations. The composition of life present at Antarctic is very specific, with a presence of organisms including prokaryotes and eukaryotes, such as fungi, protists and algae. Among the algae, Prasiola crispa is an organism most commonly found, representing an important primary producer. However, the molecular mechanisms involved with the adaptive potential of P. crispa for this environment are still unknown. Therefore, to better understand the capacity of adaptation and development of P. crispa to these conditions, was made by Illumina-Hiseq 2500 sequencer, the achievement of the transcriptome this organism. Posteriorly, based on utilization of specific softwares, was made the respective assembly and annotation of the datas coming of sequencing. The assembly of the transcriptome of P. crispa resulted in 37,679 contigs, with an N50 of 1,389. The annotation procedure allowed the identification of the organisms with greater similarity with P. crispa, where stand out other Chlorophyta belonging to Antarctic environment. Can be performed the classification of the transcripts in three different categories, biological process, molecular functions and cellular components, as well as the view of their respective E-values. Lastly, can be performed the identification of 27 transcripts that possible help P. crispa to survive in the Antarctic environment. Being the same distributed in characteristics related to resistance and tolerance to low temperatures, high incidences of ultraviolet radiation, substances and nutrients transports and high salinity levels.
Keywords: Prasiola crispa
Transcriptoma
Sequenciamento
transcriptome
Sequencing
metadata.dc.subject.cnpq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
metadata.dc.language: por
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal do Pampa
metadata.dc.publisher.initials: UNIPAMPA
metadata.dc.publisher.department: Campus São Gabriel
metadata.dc.publisher.program: Especialização Cidades, Culturas e Fronteiras 2 ed
Citation: MACEDO, Pablo Echeverria. Análise transcriptomica de prasiola crispa (lightfoot) kützing revela estratégias de resistência ao ambiente antártico. 2017. 63 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas). Universidade Federal do Pampa. Campus São Gabriel. São Gabriel. 2017.
metadata.dc.rights: Acesso Aberto
URI: http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/4535
Issue Date: 2-Mar-2017
Appears in Collections:Mestrado e Doutorado em Ciências Biológicas



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