Please use this identifier to cite or link to this item: http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/2857
metadata.dc.type: Trabalho de Conclusão de Curso
Title: Descrição metodológica do uso de marcadores moleculares associado a informações de pedigree na predição do valor genético de animais por simulação utilizando a metodologia BLUP
Other Titles: Methodological description of the use of molecular markers linked to pedrigree information in predicting the value of animal genetic by using the simulation methodology BLUP
metadata.dc.creator: Reis, Ândrea Plotzki
metadata.dc.contributor.advisor1: Schwengber, Eduardo Brum
metadata.dc.contributor.advisor-co1: Cardoso, Fernando Flores
metadata.dc.contributor.referee1: Schwengber, Eduardo Brum
metadata.dc.contributor.referee2: Yokoo, Marcos Jun-Iti
metadata.dc.contributor.referee3: Oliveira, Mauricio Morgado de
metadata.dc.description.resumo: O presente trabalho teve por objetivo comparar estimativas de valores genéticos dos animais por meio de pedigree tradicional e o mesmo, porém associado a marcadores moleculares, verificando a similaridade genotípica e frequência gênica, além de descrever os passos para realizar essa análise. Foram gerados arquivos de pedigree tradicional (“pedigree.txt”) e de animais genotipados (“marcadores.txt”) com marcadores do tipo SNP para análises do BLUP tradicional e marcador, respectivamente, juntamente com um arquivo de fenótipos (“fenotipo.txt”) que também foi gerado. Para a seleção tradicional foi montada a matriz de parentesco, onde apresenta o valor genético médio dos animais, baseada no pedigree. Na seleção genômica obteve-se a matriz genômica, que apresentou o valor genético genômico dos animais, baseado nos marcadores moleculares do tipo SNP. Quando comparadas, a seleção genômica foi superior em 13% sobre a seleção tradicional, apresentando correlações de 0,95 e 0,83, respectivamente, com o valor genético verdadeiro. Os resultados deste estudo revelam um grande potencial da seleção genômica em aumentar a eficiência do melhoramento genético, uma vez que as predições genômicas aumentam a acurácia de seleção comparado com a seleção tradicional.
Abstract: The present study aims to compare estimates of breeding values using traditional pedigree and the ute molecular markers to in order to ascertain, the similarity checking genotypic and gene frequency, and describe the steps to perform such analysis. Files were generated from traditional pedigree ("pedigree.txt") and genotyped animals ("marcadores.txt") with the type SNP markers for analysis of traditional BLUP and marker, respectively, together with a phenotypes file ("fenotipo.txt ") that was also generated. For the traditional selection was assembled relationship matrix, which presents the average breeding value of animals, based on pedigree. In genomic selection to obtain the genomic matrix, that presents the genomic breeding value of animals, based on molecular markers SNP type. In comparation, the genomic selection was higher by 13% over traditional selection, with correlations of 0.95 and 0.83, respectively, with the true genetic value. The results of this study revealed a great potential of genomic selection in increasing the efficiency of breeding, since the genomic predictions increase the accuracy of selection compared to the traditional selection.
Keywords: Seleção tradicional
Seleção genômica
BLUP
Modelo misto
Tradicional selection
Genomic selection
Mixed model
metadata.dc.subject.cnpq: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
metadata.dc.language: por
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: Universidade Federal do Pampa
metadata.dc.publisher.initials: UNIPAMPA
metadata.dc.publisher.department: Campus Dom Pedrito
Citation: REIS, Ândrea Plotzki. Descrição metodológica do uso de marcadores moleculares associado a informações de pedigree na predição do valor genético de animais por simulação utilizando a metodologia BLUP. 2012. 46 f. Trabalho de Conclusão (Graduação) – Curso de Bacharelado em Zootecnia, Universidade Federal do Pampa, Dom Pedrito,RS.
metadata.dc.rights: Acesso Aberto
URI: http://dspace.unipampa.edu.br:8080/jspui/handle/riu/2857
Issue Date: 11-Jul-2012
Appears in Collections:Zootecnia

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
ÂNDREA PLOTZKI REIS.pdfÂNDREA PLOTZKI REIS 2012686,75 kBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.